모든 유전자가 다른 성질의 것이 섞여 있지 않은 순수한 한 성질로 된 것. 이런 유전자는 쉽게 나타나지 않는다. 다만 동물의 실험을 통해서 가족 안에서 번식을 여러 번 시켜서 얻을 수 있는 정도이다. 이를 다른 말로는 호모(homo)라고 하는데, 다른 성질이 유전자를 구성하는데, 있어서는 안 되는 단일 유전자의 개체 전부를 동질 유전자 계통이라고 한다. 모체로부터 분리하여 번식하거나, 복제된 생물이나 동물인 클론과 식물 잎의 모양이 똑같은 난성 쌍생아 등이 동질 유전자 의 한 예이다.